43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2895 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  82.5 
 
 		 120 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  91.43 
 
 		 71 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  84.06 
 
 		 86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  70.89 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  69.23 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  61.97 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  55.13 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  50.62 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  50.62 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  54.93 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  46.84 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  49.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  48 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  46.05 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  46.05 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  43.04 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  48 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  47.37 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  38.16 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  40.79 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  31.87 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.06 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.75 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.14 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  37.31 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  38 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 		 174 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  38 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  38 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.58 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.58 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>