28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2335 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  91.43 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  82.61 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  79.71 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  87.1 
 
 		 86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  69.12 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  65.57 
 
 		 157 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  54.41 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  52.24 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  50.72 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  52.17 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  52.17 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  48.57 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  50.72 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  50.75 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  59.32 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  45.71 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  47.76 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  45.71 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  44.93 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  46.38 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  47.76 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  42.25 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  40.85 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  36.62 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  39.39 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  40 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>