78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2896 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  76.35 
 
 		 153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  73.94 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  63.51 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  65.52 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  62.16 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  62.16 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  61.33 
 
 		 150 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  65.22 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  58.78 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  56 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  58.11 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  57.43 
 
 		 150 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  56.46 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  62.84 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  54.09 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  50 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  53.02 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  70.89 
 
 		 82 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  48.65 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  70.89 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  79.71 
 
 		 71 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  40.54 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  41.38 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  40.56 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  76.47 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  42.4 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.4 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.4 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.4 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.18 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.75 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.75 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.97 
 
 		 194 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 		 193 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  34.81 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.48 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  46.05 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.57 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.89 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.89 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2180  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 193 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.13 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  29.27 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  29.27 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  29.27 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.25 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.84 
 
 		 201 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  29.84 
 
 		 201 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  27.56 
 
 		 200 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.38 
 
 		 158 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.12 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  35.71 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  35.21 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  35.71 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  27.78 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.56 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  27.56 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.19 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2319  hypothetical protein  78.26 
 
 		 343 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  26.77 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  26.77 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  26.77 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  26.98 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>