57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1688 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  97.59 
 
 		 166 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  88.89 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  88.89 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  81.44 
 
 		 194 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  76.87 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  65.64 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  74.36 
 
 		 174 aa  216  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.3 
 
 		 193 aa  215  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.11 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.75 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  69.39 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.39 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.39 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.39 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  58.13 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  56.95 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  48.8 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  38.18 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  38.18 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  36.14 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  40.61 
 
 		 153 aa  98.2  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  97.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  37.58 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  42.52 
 
 		 150 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  42.52 
 
 		 150 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  38.04 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  36.91 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  34.78 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  32.72 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  28.31 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  34.38 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.13 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  34.67 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  39.47 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  46.43 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  28.39 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.23 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.11 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  44.64 
 
 		 86 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 		 213 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  26.32 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  27.34 
 
 		 195 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  30.38 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  23.03 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.16 
 
 		 190 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.67 
 
 		 423 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>