50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2081 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  65.79 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  60.93 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  60.26 
 
 
154 aa  197  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  56.58 
 
 
153 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  60.93 
 
 
154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  48.65 
 
 
153 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  48.23 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  46.98 
 
 
150 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  49.34 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  46.62 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  49.28 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  46.62 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  44.37 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  44.83 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  41.46 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  44 
 
 
150 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  45.27 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  45.27 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  43.54 
 
 
151 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  43.24 
 
 
150 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  45.95 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.26 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.26 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.54 
 
 
163 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  41.35 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.11 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.8 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.2 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.8 
 
 
194 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.6 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.1 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  36.97 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.12 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  35.58 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  46.05 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  44.3 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  41.77 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  46.27 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  32 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  27.93 
 
 
145 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.87 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>