50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2174 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 		 150 aa  309  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  77.85 
 
 		 150 aa  246  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  76.51 
 
 		 150 aa  241  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  75 
 
 		 151 aa  239  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  72.97 
 
 		 151 aa  238  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  71.81 
 
 		 151 aa  237  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  69.59 
 
 		 150 aa  222  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  60.4 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  62.42 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  58.11 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  56.38 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  56.38 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  59.42 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  54.93 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  51.72 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  52.7 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  44 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  44.03 
 
 		 165 aa  123  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  44.3 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.33 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  38.36 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  34.46 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  40.41 
 
 		 154 aa  93.2  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  38.36 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  37.75 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  47.5 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.18 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.82 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.41 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.41 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  48 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.1 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  50.72 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.85 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.85 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.59 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  58.06 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  29.19 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  35.63 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  34.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  26.14 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.32 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>