60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  70.67 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  69.59 
 
 		 150 aa  223  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  69.59 
 
 		 150 aa  222  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  66.22 
 
 		 151 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  65.54 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  64.86 
 
 		 150 aa  206  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  64.19 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  63.51 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  61.33 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  61.59 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  62.68 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  57.24 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  56.67 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  56.67 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  58.78 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  48.77 
 
 		 165 aa  140  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  46.98 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  46.26 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  44.9 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  38.89 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  39.6 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.82 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.42 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.42 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.75 
 
 		 193 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.69 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  36.81 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  38.41 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  44.3 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.85 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.85 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  43.04 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.06 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.22 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  33.88 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  44.93 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  36.36 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  42.65 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.67 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.26 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.72 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  27.96 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.26 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  27.96 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.07 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  30.67 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  32 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 		 198 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.7 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>