50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1758 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  309  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  76.51 
 
 		 150 aa  244  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  74.32 
 
 		 151 aa  237  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  71.81 
 
 		 150 aa  237  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  72.3 
 
 		 151 aa  233  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  75.17 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  70.67 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  62.42 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  59.73 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  60.87 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  56 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  56.34 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  53.33 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  53.33 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  54.73 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  44.37 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  44.97 
 
 		 153 aa  120  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  40.85 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  40.62 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  36.91 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  40.27 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  35.66 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  35.2 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  45 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  46.05 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  36 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  36 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  48.57 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.2 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.2 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.2 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.6 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.75 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.75 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  30.67 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.71 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  44.12 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  53.23 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  37.93 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  30.25 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.18 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1270  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.33 
 
 		 174 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>