81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4220 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 165 aa  336  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 165 aa  336  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  88.34 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  88.89 
 
 		 166 aa  278  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  82.21 
 
 		 194 aa  255  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  80.14 
 
 		 163 aa  233  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  66.88 
 
 		 161 aa  227  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  73.97 
 
 		 163 aa  225  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  76.71 
 
 		 163 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.34 
 
 		 193 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.34 
 
 		 163 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.08 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.29 
 
 		 163 aa  213  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.29 
 
 		 163 aa  213  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.29 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  60.62 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  60 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  48.47 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  39.02 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  41.88 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  37.95 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  40.99 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  39.02 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  38.22 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  42.74 
 
 		 151 aa  90.9  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  30.91 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  37.74 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  42.98 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  37.74 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  36.48 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  40.65 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  35.85 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  36.48 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  33.12 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  36.77 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  29.68 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  32.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  32.61 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  33.13 
 
 		 423 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.11 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.14 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.67 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  34.15 
 
 		 213 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  28.26 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  24.54 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.77 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  28.72 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.67 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.67 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 		 188 aa  43.9  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  26.85 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.17 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  32 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  26.17 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  28.57 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 405 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.67 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  37.33 
 
 		 237 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  37.84 
 
 		 264 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.28 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  27.17 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.47 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.99 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.58 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>