56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2324 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  76.35 
 
 		 151 aa  240  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  72.48 
 
 		 150 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  74.65 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  63.51 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  66.9 
 
 		 152 aa  196  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  67.39 
 
 		 151 aa  193  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  62.42 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  64.43 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  64.43 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  60.4 
 
 		 150 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  59.73 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  61.07 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  59.86 
 
 		 151 aa  180  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  58.5 
 
 		 151 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  60.81 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  52.2 
 
 		 165 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  48.65 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  51.68 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  72.5 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  69.23 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  45.75 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  71.43 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  69.12 
 
 		 71 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  46.09 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.88 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.09 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.09 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.31 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.19 
 
 		 193 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.31 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  40.8 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  44.62 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.97 
 
 		 194 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  35.85 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  45.45 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.39 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  63.64 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.88 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  29.09 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2319  hypothetical protein  82.61 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.05 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.35 
 
 		 200 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.35 
 
 		 200 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.19 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  35.94 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>