55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2016 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  97.59 
 
 		 166 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  88.34 
 
 		 165 aa  280  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  88.34 
 
 		 165 aa  280  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  80.84 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  77.4 
 
 		 163 aa  226  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  66.25 
 
 		 161 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.08 
 
 		 174 aa  215  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.29 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.29 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.92 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  70.55 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.55 
 
 		 163 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.55 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.55 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  58.13 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  56.95 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  49.4 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  38.41 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  38.18 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  36.97 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  40.61 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  37.8 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  38.04 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  40.32 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  28.48 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  35.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  35.22 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  34.59 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  34.59 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  33.75 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  34 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  38.6 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  38.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  46.43 
 
 		 120 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  32.61 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  32.61 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  28.39 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  44.64 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.8 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.53 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.39 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  27.54 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  23.17 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.19 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>