99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4840 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4840  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 395 aa  737    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1886  sodium/hydrogen exchanger  57.29 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2280  sodium/hydrogen exchanger  61.69 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0433  sodium/hydrogen exchanger  59.72 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 712 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  23.38 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.09 
 
 		 609 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.9 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.16 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.9 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.9 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.9 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.9 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.9 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.44 
 
 		 609 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.64 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  21.3 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  21.3 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 698 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  24.28 
 
 		 609 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  23.58 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 692 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  20.62 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  20.36 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.77 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.95 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  22.65 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 679 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 688 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0192  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 552 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.870085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  23.1 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  23.1 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  23.47 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  23.1 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  21.78 
 
 		 608 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  22.76 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 709 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.1 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  23.1 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  22.76 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  23.84 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  22.34 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  22.76 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  22.47 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  22.76 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  24.54 
 
 		 382 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 445 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 595 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.49 
 
 		 375 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  20.6 
 
 		 530 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.64 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.54 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  22.76 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 		 689 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 665 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.78 
 
 		 648 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.78 
 
 		 648 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 629 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.78 
 
 		 648 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  24.64 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0163  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0515868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  22.34 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  27.83 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 		 636 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 597 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  23.59 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.86 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.8 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 583 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 583 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.17 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.19 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  21.43 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.3 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 609 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 491 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>