More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4287 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 405 aa  807    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0790  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.52 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03730  D-mannonate dehydratase  64.15 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2407  mandelate racemase/muconate-lactonizing protein  60.05 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.29 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.33 
 
 		 404 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.82 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.33 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.98 
 
 		 406 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.73485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.83 
 
 		 404 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.52 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4500  starvation sensing protein  55.33 
 
 		 404 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.244455  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.33 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1619  starvation-sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000210785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1654  starvation-sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0315691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.84 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2983  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.59 
 
 		 411 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0331585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4722  Galactonate dehydratase  57.96 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44454  normal  0.932737 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.58 
 
 		 404 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  55.09 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  55.09 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.36 
 
 		 407 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  61.1 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0048  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.79 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.396103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.41 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.96 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0553665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  54.84 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.35 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.05 
 
 		 402 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000550231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.72 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.06 
 
 		 403 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  56.97 
 
 		 402 aa  474  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  58.13 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1004  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.58 
 
 		 403 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.123594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.71 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316488  normal  0.738385 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  53.23 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.46 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  53.23 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  56.97 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.22 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3978  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  55.33 
 
 		 403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1889  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.97 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0204033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  56.97 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  56.97 
 
 		 402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0766  starvation sensing protein RspA  56.47 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1064  galactokinase  53.98 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0037  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.09 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0583  starvation sensing protein RspA  56.47 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0980874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2883  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.33 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0617503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3561  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.81 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0694  starvation sensing protein RspA  56.47 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.58786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1648  starvation sensing protein RspA  56.47 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2974  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  54.09 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03854  starvation sensing protein  54.48 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.47 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3675  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.97 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  50 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0398096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.98 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.213701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.3 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0977  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.66 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000913378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.65 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4410  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.08 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1541  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, C- domain protein  37.38 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.5 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5328  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.67 
 
 		 415 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0192  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.91 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.82 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.851358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.34 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4063  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.82 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1008  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.75 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.570237  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.95 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.16 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.22 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  35.25 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  36.14 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.76 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  35.77 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  32.75 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  32.07 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  35.77 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  35.35 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  32.32 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  33.17 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  33.5 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  34.31 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  35.77 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  34.79 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  34.79 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  34.79 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  32.6 
 
 		 382 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  34.55 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  34.55 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  34.55 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>