108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0214 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  100 
 
 
68 aa  133  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  48.48 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  51.47 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  45.45 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  60.38 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  60.38 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  38.81 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  39.68 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  48.33 
 
 
403 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  60.38 
 
 
66 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  43.94 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  58.49 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  58 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  56 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  56 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  54.72 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  39.39 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  39.39 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  40 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  38.71 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1313  50S ribosomal protein L35  43.48 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.711955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  41.07 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  41.54 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  36.92 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  39.06 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  36.92 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  42.86 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0476  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  35.48 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  38.71 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  35.38 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  45.28 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  32.81 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  64.52 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  64.52 
 
 
64 aa  43.5  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1252  ribosomal protein L35  37.88 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.695643  normal  0.22222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  38.46 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  42.65 
 
 
73 aa  42.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  37.5 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0233  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.378648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  37.31 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0573  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  32.31 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  41.18 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  42.65 
 
 
67 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  40 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  37.88 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  40.3 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
81 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  45.28 
 
 
65 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
67 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  61.29 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  39.71 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  38.46 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  38.71 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>