76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0415 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  100 
 
 
524 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  75.99 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  60.68 
 
 
525 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  60.11 
 
 
525 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  60.11 
 
 
525 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  45.84 
 
 
513 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  55.51 
 
 
434 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  68.02 
 
 
435 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  39.92 
 
 
463 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  66.85 
 
 
556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  36.45 
 
 
539 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  65.54 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  70.11 
 
 
536 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  40.21 
 
 
496 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  49.31 
 
 
452 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  49.31 
 
 
452 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  47.54 
 
 
443 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  47.54 
 
 
443 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  47.54 
 
 
443 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  42.13 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  53.85 
 
 
368 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  42.29 
 
 
439 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  66.67 
 
 
315 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  72.73 
 
 
77 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  42.01 
 
 
445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  47.17 
 
 
450 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  43.64 
 
 
406 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  39.66 
 
 
396 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  44.23 
 
 
423 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  42.77 
 
 
350 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  41.55 
 
 
391 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  42.77 
 
 
350 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  43.54 
 
 
443 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  43.62 
 
 
380 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  38.67 
 
 
385 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  39.08 
 
 
392 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  41.84 
 
 
391 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  38.69 
 
 
760 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  43.29 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  40.36 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  33.53 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  40.32 
 
 
3295 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  45.03 
 
 
423 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  41.59 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  41.4 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  41.57 
 
 
409 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  42.19 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  39.76 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  42.53 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  40 
 
 
580 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  38.46 
 
 
1457 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  40.13 
 
 
3166 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  41.92 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  47.55 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  40.7 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  40.72 
 
 
394 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  43.2 
 
 
394 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  44.3 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  37.87 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  36.67 
 
 
645 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  39.75 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  32.74 
 
 
346 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  36.18 
 
 
409 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  37.01 
 
 
1013 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  40 
 
 
975 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  36.71 
 
 
3787 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  27.75 
 
 
176 aa  57  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  27.75 
 
 
173 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  33.04 
 
 
213 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  28 
 
 
178 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5774  PPE protein  45.45 
 
 
413 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.118496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  35.76 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13156  PPE family protein  47.37 
 
 
185 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  39.33 
 
 
2532 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  38.85 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  35.71 
 
 
590 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>