34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0637 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.32 
 
 		 197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  48.4 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  48.72 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  45.74 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.09 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.68 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  31.09 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.32 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.91 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.51 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.5 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.7 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.98 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.41 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.48 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  25 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  25.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.87 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  23.16 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.48 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.49 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  24.48 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.77 
 
 		 559 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.39 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  22.73 
 
 		 490 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  25.13 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  28.15 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.93 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.35 
 
 		 212 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2838  hypothetical protein  26.72 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>