49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1602 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1602  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0552613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0747  hypothetical protein  50.6 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.301449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1171  hypothetical protein  46.84 
 
 		 186 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7653  protein of unknown function DUF721  45.34 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3373  protein of unknown function DUF1159  45.22 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190252  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3178  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3502  protein of unknown function DUF721  44.16 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4979  protein of unknown function DUF1159  43.05 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2320  hypothetical protein  46.48 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6940  hypothetical protein  44.23 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0717  hypothetical protein  45.86 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.695432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3228  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2606  hypothetical protein  41.61 
 
 		 209 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.23645  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1069  hypothetical protein  40.94 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4371  hypothetical protein  40.79 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0866118  normal  0.0388954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1198  hypothetical protein  40.27 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0766  hypothetical protein  34.84 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0494  hypothetical protein  37.91 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0498  hypothetical protein  37.91 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0422598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0611  hypothetical protein  36.42 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0544  hypothetical protein  31.41 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21317  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0416  hypothetical protein  24.69 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2644  hypothetical protein  34.59 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  32.48 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0708  protein of unknown function DUF721  29.11 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0555982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4691  hypothetical protein  36.72 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165026  normal  0.387608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0653  protein of unknown function DUF1159  29.94 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1091  hypothetical protein  27.47 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3250  hypothetical protein  37.32 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.745967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0959  hypothetical protein  33.56 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2267  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0396  hypothetical protein  27.56 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.939834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1465  hypothetical protein  34.23 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0116  hypothetical protein  33.56 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  31.41 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0063  hypothetical protein  32.21 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.448388  normal  0.368675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.7 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  27.7 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.73 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  28.45 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  27.95 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0349  hypothetical protein  26.47 
 
 		 108 aa  43.9  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.182505  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0390  hypothetical protein  26.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4370  hypothetical protein  27.92 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2096  hypothetical protein  28.87 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  26.35 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  24.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  24.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  24.51 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>