More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1241 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  100 
 
 
448 aa  905    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  61.61 
 
 
449 aa  568  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  62.14 
 
 
453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  38.76 
 
 
546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  38.76 
 
 
546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.09 
 
 
548 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  40.43 
 
 
546 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  40.69 
 
 
767 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  40.09 
 
 
550 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  42.86 
 
 
457 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  40.04 
 
 
745 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  39.96 
 
 
546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  39.83 
 
 
767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.88 
 
 
469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.28 
 
 
469 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  39.96 
 
 
481 aa  296  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  37.37 
 
 
468 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  36.34 
 
 
468 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  36.72 
 
 
468 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  37.24 
 
 
485 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  36.74 
 
 
484 aa  276  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  37.85 
 
 
479 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  38.66 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  38.31 
 
 
562 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  38.96 
 
 
561 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  38.3 
 
 
478 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.76 
 
 
462 aa  266  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  39.02 
 
 
477 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  39.11 
 
 
562 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  38.92 
 
 
562 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  37.88 
 
 
561 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  35.93 
 
 
467 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  37.96 
 
 
560 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  37.31 
 
 
561 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  37.31 
 
 
561 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  37.31 
 
 
561 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  37.31 
 
 
561 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  37.58 
 
 
551 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  37.5 
 
 
547 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  36.29 
 
 
550 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  37.45 
 
 
561 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  37.1 
 
 
561 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  37.1 
 
 
561 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  37.28 
 
 
547 aa  256  7e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  37.31 
 
 
561 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  37.96 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  35.79 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  38.68 
 
 
565 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  36.5 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  35.65 
 
 
480 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  36.8 
 
 
479 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 
459 aa  249  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  34.75 
 
 
464 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.59 
 
 
472 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  36.93 
 
 
552 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.26 
 
 
473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  35.48 
 
 
467 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.4 
 
 
475 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.4 
 
 
475 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.71 
 
 
471 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  35.73 
 
 
476 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  38.03 
 
 
564 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  38.09 
 
 
464 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  38.03 
 
 
564 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  36.01 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  37.34 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.09 
 
 
475 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  35.56 
 
 
476 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  35.56 
 
 
476 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  35.56 
 
 
476 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  36.44 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 
459 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.92 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  34.01 
 
 
557 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  35.44 
 
 
474 aa  232  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  36.12 
 
 
468 aa  232  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  36.15 
 
 
474 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 
459 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 
459 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 
468 aa  229  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.74 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.74 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  36.43 
 
 
541 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.71 
 
 
470 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.48 
 
 
704 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 
460 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.74 
 
 
465 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.67 
 
 
471 aa  226  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.19 
 
 
482 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  33.84 
 
 
484 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
459 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
466 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  38.24 
 
 
464 aa  223  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.37 
 
 
482 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.62 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 
467 aa  220  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>