55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4515 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  87.3 
 
 		 315 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  86.03 
 
 		 315 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  65.09 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  59.12 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.49 
 
 		 313 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  57.14 
 
 		 268 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.17 
 
 		 227 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.84 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.35 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  45.76 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.63 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.81 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.45 
 
 		 258 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.34 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.65 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.72 
 
 		 220 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  43.27 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  37.39 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.24 
 
 		 222 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  36.94 
 
 		 230 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  39.75 
 
 		 220 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.7 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.61 
 
 		 222 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.65 
 
 		 221 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  36.27 
 
 		 210 aa  117  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.3 
 
 		 221 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  36.53 
 
 		 212 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 212 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.58 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.53 
 
 		 212 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.06 
 
 		 212 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.93 
 
 		 223 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 203 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.19 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.25 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.72 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.58 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  31.06 
 
 		 234 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.32 
 
 		 198 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.16 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  28.18 
 
 		 193 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.16 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.22 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  21.74 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.06 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.34 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.04 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.2 
 
 		 223 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.78 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.81 
 
 		 216 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>