178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3860 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3860  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0061  cyclic nucleotide-binding protein  59.32 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3386  cyclic nucleotide-binding protein  59.32 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0784  hypothetical protein  57.63 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0075  hypothetical protein  57.2 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  55.08 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6128  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.17 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  50.43 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3376  cyclic nucleotide-binding protein  50.64 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0788  cyclic nucleotide-binding  49.37 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6918  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.05 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3012  cyclic nucleotide-binding protein  50.22 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.11 
 
 		 256 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5879  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.7 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6894  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.26 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.744269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.29 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5837  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.8 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5598  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.97 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2120  cyclic nucleotide-binding  44.25 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341739 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.48 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156733  normal  0.417355 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5762  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.35 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2397  cyclic nucleotide-binding protein  43.81 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.24 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0741  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.7 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.78 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.65 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192457  normal  0.0307688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.71 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4306  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7015  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.55 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5764  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.17 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  38.94 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.94 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  41.85 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5594  hypothetical protein  43.42 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 		 384 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4307  cyclic nucleotide-binding protein  35.86 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.44 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  38.94 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.74 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4966  cyclic nucleotide-binding protein  39.65 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.916319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.95 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  37.66 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  36.84 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  37.29 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.28 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  38.36 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  37.08 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  36.86 
 
 		 312 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2958  cyclic nucleotide-binding  36.32 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>