More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0530 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
396 aa  781    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.3 
 
 
405 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.32 
 
 
396 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.84 
 
 
405 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.04 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.78 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.13 
 
 
412 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
397 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
394 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.24 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.88 
 
 
410 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.2 
 
 
394 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.76 
 
 
394 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.68 
 
 
394 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.63 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.87 
 
 
394 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.59 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.39 
 
 
394 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.25 
 
 
399 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.03 
 
 
445 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.43 
 
 
400 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.48 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.48 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.78 
 
 
471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.22 
 
 
406 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.41 
 
 
397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.14 
 
 
405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.01 
 
 
401 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.87 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.28 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.97 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.97 
 
 
415 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.67 
 
 
396 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.47 
 
 
392 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.5 
 
 
396 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.83 
 
 
391 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.7 
 
 
389 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.14 
 
 
390 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.81 
 
 
411 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.72 
 
 
415 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.15 
 
 
391 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.24 
 
 
406 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.56 
 
 
389 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.59 
 
 
390 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.46 
 
 
391 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.99 
 
 
416 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.47 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.03 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.96 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.8 
 
 
390 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.5 
 
 
384 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.73 
 
 
389 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.3 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.41 
 
 
390 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.67 
 
 
385 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.76 
 
 
410 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.67 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.77 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.22 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  46.22 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.78 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.22 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.22 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.78 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.94 
 
 
384 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.5 
 
 
384 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 
385 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.67 
 
 
385 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.56 
 
 
396 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.6 
 
 
408 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.79 
 
 
383 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.18 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.67 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.5 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.48 
 
 
399 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.48 
 
 
395 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.97 
 
 
385 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.86 
 
 
384 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.53 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.14 
 
 
390 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.88 
 
 
392 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  41.78 
 
 
395 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.55 
 
 
389 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.55 
 
 
389 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  38.02 
 
 
395 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.4 
 
 
391 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.14 
 
 
388 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.44 
 
 
396 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.57 
 
 
393 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.98 
 
 
393 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.6 
 
 
385 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  41.02 
 
 
392 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.33 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>