117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1685 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  100 
 
 
172 aa  347  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  35.4 
 
 
168 aa  120  1e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  37.04 
 
 
216 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  37.04 
 
 
215 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  33.33 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  32.91 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.14 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  30.23 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  32.32 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  35.26 
 
 
164 aa  84  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  32.52 
 
 
167 aa  79.7  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
183 aa  78.6  5e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
183 aa  77.4  9e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  30.05 
 
 
183 aa  77  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  30.05 
 
 
183 aa  77  1e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81014e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  30.86 
 
 
177 aa  75.9  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  3.39774e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  31.33 
 
 
167 aa  75.9  3e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  30.86 
 
 
177 aa  75.9  3e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.7226e-07  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  30.86 
 
 
177 aa  75.9  3e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.32863e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  31.93 
 
 
170 aa  75.5  4e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 
184 aa  73.6  1e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 
174 aa  73.6  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  29.76 
 
 
193 aa  73.6  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 
181 aa  72.8  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  31.61 
 
 
176 aa  72.4  3e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  28.02 
 
 
184 aa  72  4e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
184 aa  72  4e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.5966e-05  hitchhiker  9.9426e-07 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  28.4 
 
 
181 aa  71.6  6e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  28.65 
 
 
177 aa  70.5  1e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  28.89 
 
 
184 aa  70.5  1e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
184 aa  70.5  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  29.71 
 
 
180 aa  69.3  2e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
178 aa  68.2  5e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  28.09 
 
 
188 aa  68.2  5e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  28.07 
 
 
175 aa  67.8  7e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  24.69 
 
 
164 aa  66.2  2e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 
173 aa  65.9  3e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  27.06 
 
 
170 aa  64.7  5e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 
177 aa  63.5  1e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
179 aa  63.9  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  29.7 
 
 
174 aa  62.4  3e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  7.94828e-07  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
175 aa  61.2  6e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  32.58 
 
 
140 aa  61.2  6e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 
181 aa  61.2  6e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.64139e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  26.14 
 
 
179 aa  61.2  6e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  31.06 
 
 
159 aa  61.2  7e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
179 aa  61.2  7e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  24.86 
 
 
190 aa  60.8  8e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 
181 aa  60.8  8e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.33684e-07  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
181 aa  60.5  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  8.43735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 
179 aa  60.5  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  26.59 
 
 
179 aa  60.5  1e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  25.86 
 
 
175 aa  59.7  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.43 
 
 
158 aa  59.7  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.31743e-05  decreased coverage  2.39257e-06 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.24 
 
 
197 aa  59.7  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.41436e-05  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  27.81 
 
 
175 aa  60.1  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.48526e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  26.9 
 
 
176 aa  60.1  2e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 
181 aa  60.1  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.11087e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 
173 aa  58.2  5e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 
173 aa  58.2  5e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 
173 aa  58.2  6e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 
173 aa  57.8  8e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 
173 aa  57.4  9e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  27.43 
 
 
179 aa  57.4  1e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  5.14113e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 
175 aa  56.2  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.62535e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  27.22 
 
 
176 aa  56.6  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  23.67 
 
 
173 aa  56.2  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 
177 aa  56.6  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
181 aa  55.8  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  9.03845e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
181 aa  55.8  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.39833e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
181 aa  55.8  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  3.09624e-05  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 
181 aa  55.8  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  25.42 
 
 
175 aa  55.5  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.84734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.54 
 
 
193 aa  54.7  6e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  26.82 
 
 
179 aa  54.7  6e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  27.38 
 
 
174 aa  54.3  7e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.80551e-05  hitchhiker  1.45429e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  24.07 
 
 
173 aa  54.7  7e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  27.38 
 
 
174 aa  54.7  7e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.30188e-08  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 
173 aa  54.7  7e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  24.69 
 
 
173 aa  54.7  7e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  27.38 
 
 
174 aa  54.7  7e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  6.64462e-06  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 
175 aa  54.3  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  25.56 
 
 
181 aa  54.3  8e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.19448e-06  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  28.4 
 
 
174 aa  54.3  9e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
174 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  24 
 
 
173 aa  52.4  3e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
174 aa  52.4  3e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
174 aa  52  4e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  1.79508e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
174 aa  51.6  5e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 
174 aa  49.3  2e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.81009e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  26.29 
 
 
174 aa  49.3  2e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.71 
 
 
160 aa  47.8  8e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.68 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 
173 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>