163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1206 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 		 361 aa  739    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  60.22 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  47.35 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  37.06 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  38.98 
 
 		 436 aa  225  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.9 
 
 		 484 aa  219  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.24 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.96 
 
 		 392 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.85 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.3 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.48 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.51 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  35.34 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.32 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  34.85 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.98 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.44 
 
 		 472 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.48 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.39 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  34.86 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.79 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.79 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  35.54 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.78 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  33.51 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.96 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.16 
 
 		 391 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  32.71 
 
 		 407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.36 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.88 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.88 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.16 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.01 
 
 		 392 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 390 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.69 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.27 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.62 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.38 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.35 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  33.99 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.18 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.52 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  36.8 
 
 		 502 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.97 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.38 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.71 
 
 		 403 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.7 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.64 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.37 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.73 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.79 
 
 		 484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.79 
 
 		 484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.44 
 
 		 484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.49 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.8 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.15 
 
 		 500 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.71 
 
 		 482 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.71 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.99 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  32 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  32 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  32 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.07 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.23 
 
 		 482 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.09 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.09 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.4 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.09 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.09 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.27 
 
 		 484 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.22 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.22 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.24 
 
 		 484 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.69 
 
 		 484 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  44.62 
 
 		 212 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.6 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.13 
 
 		 515 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.1 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  46.15 
 
 		 213 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  32.15 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.68 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  31.2 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.2 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>