158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1138 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  153  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  58.33 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  57.14 
 
 
80 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  51.43 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  49.28 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  49.28 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  50.72 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  48.53 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  46.38 
 
 
74 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  44.29 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  42.47 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  50.82 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  53.23 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  44 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  53.23 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  40.54 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  47.06 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  43.48 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  39.19 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  39.19 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  41.79 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  42.65 
 
 
796 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  40.68 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  43.48 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  38.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  40.98 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  47.27 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  36.76 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  42.62 
 
 
80 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  38.24 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  34.29 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  38.24 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.82 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.88 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  36.23 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  33.33 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  36.23 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  36.23 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  31.88 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  32.35 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  38.03 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.88 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  33.33 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  32.84 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  32.84 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  34.78 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  30.99 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  33.33 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  33.82 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  32.35 
 
 
77 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  38.18 
 
 
85 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  32.35 
 
 
77 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  33.82 
 
 
77 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  40.35 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  36.76 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.88 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.66 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.57 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  31.51 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  46.27 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.51 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  28.38 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  28.17 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  32.88 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  33.33 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  43.28 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  31.88 
 
 
213 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  46.15 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  38.46 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>