More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5925 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 258 aa  507  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  83.2 
 
 		 257 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  60.47 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  58.66 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  58.04 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  56.76 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  56.64 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  57.09 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.04 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  57.87 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.64 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.64 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.91 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.72 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.91 
 
 		 258 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  56.69 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.51 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  53.94 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.49 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.52 
 
 		 258 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  56.25 
 
 		 256 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.1 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.52 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  56.92 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  52.73 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.12 
 
 		 257 aa  261  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.65 
 
 		 257 aa  261  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.38 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.34 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.78 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.86 
 
 		 261 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.63 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.99 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.33 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.33 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  53.73 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.33 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.76 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.61 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  49.37 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.42 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.06 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.06 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.19 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  49.41 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.04 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.04 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.04 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  53 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  45.56 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.27 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  49.22 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.08 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.62 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  42.45 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.8 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.03 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  42.41 
 
 		 344 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.08 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.53 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.5 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  44.31 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.69 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  41.22 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.36 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  43.19 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.58 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  40.62 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.25 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  41.09 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.38 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  39 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  43.36 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  40.07 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.19 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.99 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.7 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  51.03 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.23 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.4 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.34 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.57 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  26.02 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.16 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>