259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5871 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 342 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  47.73 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  48.57 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  48.72 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  48.25 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  47.77 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  44.51 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  44.01 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  44.01 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  45.45 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 		 340 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  43.77 
 
 		 351 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  43.13 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  43.45 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.58 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  40.58 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 		 336 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.66 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  34.7 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  34.7 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.38 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.38 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  34.38 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  32.84 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  34.93 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  30.07 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  26.75 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  28.47 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  30.11 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.44 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.44 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  27.51 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  29.2 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3474  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.29 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  30.43 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.63 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.83 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.81 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.17 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 470 aa  90.5  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  28.31 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  28.77 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0924  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1201  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.523727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  24.84 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>