More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1734 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  100 
 
 
328 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  84.05 
 
 
328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  65.33 
 
 
328 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  59.82 
 
 
327 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
328 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  56 
 
 
324 aa  351  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  56.57 
 
 
360 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  54.91 
 
 
328 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  55.35 
 
 
327 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
327 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  53.21 
 
 
328 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  55.66 
 
 
329 aa  346  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  53.46 
 
 
317 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  54.74 
 
 
326 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
335 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  56.48 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  57.85 
 
 
329 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  54.74 
 
 
491 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  55.35 
 
 
328 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  54.46 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  53.35 
 
 
328 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  52.92 
 
 
330 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  55.96 
 
 
331 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  55.83 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  56.27 
 
 
328 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  52.44 
 
 
330 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  56.27 
 
 
331 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  52.15 
 
 
328 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  51.66 
 
 
331 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  54.57 
 
 
334 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  57.45 
 
 
320 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  53.07 
 
 
331 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  54.32 
 
 
340 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
330 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  56.83 
 
 
329 aa  328  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  56.83 
 
 
329 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  54.74 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  53.58 
 
 
449 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  53.99 
 
 
333 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  50.77 
 
 
326 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  55.41 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
328 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  51.23 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
328 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  53.9 
 
 
332 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.53 
 
 
331 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
332 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  58.75 
 
 
327 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  55.26 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  51.85 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
331 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  51.95 
 
 
333 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
330 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  48.29 
 
 
328 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  56.66 
 
 
330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
320 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3488  putative aldo/keto reductase  47.59 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0487962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  54.21 
 
 
317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  52.83 
 
 
338 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  54.23 
 
 
333 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  51.69 
 
 
325 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  53.55 
 
 
320 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
334 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  53.07 
 
 
324 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.14 
 
 
329 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  48.14 
 
 
329 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
335 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.14 
 
 
329 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  53.09 
 
 
334 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1438  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
333 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.020448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
322 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
326 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
325 aa  292  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3695  aldo/keto reductase  51.83 
 
 
332 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  48.2 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
331 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
331 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
334 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
327 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  52.04 
 
 
325 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2860  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
331 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0184279  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
327 aa  288  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  47.13 
 
 
342 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.68 
 
 
327 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
334 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.46 
 
 
328 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.27 
 
 
329 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  46.81 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0302  aldo/keto reductase  48.62 
 
 
334 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.721467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.77 
 
 
334 aa  285  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  48.92 
 
 
328 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  46.27 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  45.96 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
331 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  46.88 
 
 
327 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  48.77 
 
 
331 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>