More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5429 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5429  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.308661 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5604  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.689274  normal  0.6989 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5826  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.27986 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6005  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000975175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  94.17 
 
 		 317 aa  206  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  94.17 
 
 		 375 aa  205  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  94.17 
 
 		 317 aa  206  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  68.63 
 
 		 317 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4641  hypothetical protein  92.06 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  48.96 
 
 		 189 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  48.96 
 
 		 308 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  47.92 
 
 		 278 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  47.92 
 
 		 294 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  48.96 
 
 		 288 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  44.9 
 
 		 301 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  44.9 
 
 		 301 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  44.9 
 
 		 301 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  47.92 
 
 		 278 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  43.88 
 
 		 291 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 299 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 299 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  48.04 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  47.62 
 
 		 284 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  47.62 
 
 		 284 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  47.62 
 
 		 284 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  47.62 
 
 		 284 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 301 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 301 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  46.15 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  46.15 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 285 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  45.1 
 
 		 283 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  48.94 
 
 		 283 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  47.96 
 
 		 279 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  47.96 
 
 		 279 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  47.96 
 
 		 279 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  47.96 
 
 		 279 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  47.96 
 
 		 279 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  47.96 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 301 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 301 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 301 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 301 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  46.81 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  46.81 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  47.06 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  47.25 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  49.37 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  46.74 
 
 		 282 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  46.74 
 
 		 282 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  45.1 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  46.84 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 295 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  44.57 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 244 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0115  ISBt3 transposase subunit protein  45.63 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35522  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  45.74 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  43.48 
 
 		 296 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  43.48 
 
 		 295 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  43.48 
 
 		 295 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  43.48 
 
 		 296 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 301 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  43.48 
 
 		 301 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>