More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1892 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  100 
 
 
343 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  100 
 
 
343 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  94.17 
 
 
343 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  100 
 
 
343 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  91.84 
 
 
343 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  89.21 
 
 
343 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  82.22 
 
 
345 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  68.51 
 
 
342 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  58.31 
 
 
341 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  58.31 
 
 
341 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  58.43 
 
 
341 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  57.14 
 
 
341 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  58.6 
 
 
340 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  58.09 
 
 
341 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  57.27 
 
 
342 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  56.85 
 
 
341 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  55.94 
 
 
341 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  55.94 
 
 
341 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  55.1 
 
 
341 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  56.85 
 
 
342 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  56.56 
 
 
342 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  56.56 
 
 
342 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  54.2 
 
 
346 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  53.22 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  50.73 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  51.05 
 
 
341 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 
343 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  49.7 
 
 
341 aa  328  6e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  50.3 
 
 
340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  52.46 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  50.58 
 
 
341 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  49.15 
 
 
365 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  50.29 
 
 
341 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  47.09 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  48.6 
 
 
363 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  48.26 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  46.33 
 
 
362 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  46.96 
 
 
344 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  48.31 
 
 
373 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.24 
 
 
349 aa  299  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  48.55 
 
 
368 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  48.54 
 
 
343 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 
363 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  46.94 
 
 
370 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  47.89 
 
 
364 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  43.33 
 
 
366 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  46.7 
 
 
345 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  43.33 
 
 
365 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  43.4 
 
 
368 aa  285  5.999999999999999e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  46.18 
 
 
339 aa  285  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  45.61 
 
 
360 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  44.79 
 
 
359 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  45.45 
 
 
370 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  45.76 
 
 
363 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  47.94 
 
 
375 aa  278  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  50 
 
 
356 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 
351 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  46.46 
 
 
372 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  46.51 
 
 
367 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  46.86 
 
 
372 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  44.07 
 
 
361 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  42.86 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  43.4 
 
 
363 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.44 
 
 
346 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  44.19 
 
 
359 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  44.18 
 
 
364 aa  262  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  45.22 
 
 
365 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  43.03 
 
 
358 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  44.74 
 
 
362 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  43.22 
 
 
378 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  43.71 
 
 
365 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  44.54 
 
 
369 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  44.48 
 
 
342 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  43.54 
 
 
350 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  43.54 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  43.07 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  43.55 
 
 
368 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  41.59 
 
 
319 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.59 
 
 
319 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  41.9 
 
 
319 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  42.18 
 
 
322 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  42.54 
 
 
321 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  38.07 
 
 
324 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  42.55 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  41.59 
 
 
322 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  42.41 
 
 
328 aa  225  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  41.47 
 
 
319 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  38.21 
 
 
332 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  38.69 
 
 
322 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  42.02 
 
 
319 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  39.12 
 
 
320 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 
319 aa  222  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 
319 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 
319 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4356  6-phosphofructokinase  39.12 
 
 
320 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  39.12 
 
 
320 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  39.12 
 
 
320 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  39.12 
 
 
320 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>