More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0173 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  50.48 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  50.72 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  49.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  47.64 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  49.3 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  48.83 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  47.87 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  43.23 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  45.24 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  46.01 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  45.91 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  44.75 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  47.83 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  48.28 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  43.93 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  44.44 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  46.12 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2238  cytidylate kinase  49.28 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000316854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  46.38 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  46.38 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  46.38 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  46.38 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  44.93 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  45.24 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.92 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  46.41 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.46 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.26 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  44.65 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  37.28 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15860  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1211  cytidylate kinase  46.51 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00218748  normal  0.15361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.09 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.06 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  41.4 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.84 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  38.74 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  35.81 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.38 
 
 		 674 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  39.15 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40.95 
 
 		 699 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>