More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0063 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  94.91 
 
 
373 aa  734  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  94.35 
 
 
373 aa  733  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  100 
 
 
373 aa  769  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  69.84 
 
 
380 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  54.3 
 
 
370 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  53.13 
 
 
373 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  53.93 
 
 
389 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  50.94 
 
 
373 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  53.12 
 
 
386 aa  399  1e-110  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  50.14 
 
 
391 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  52.85 
 
 
386 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  51.35 
 
 
388 aa  381  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  48.52 
 
 
377 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  47.51 
 
 
390 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  44.92 
 
 
390 aa  361  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  47.43 
 
 
369 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  48.92 
 
 
390 aa  358  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  48.25 
 
 
390 aa  358  1e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  48.12 
 
 
379 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  46.54 
 
 
371 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  47.43 
 
 
389 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  47.04 
 
 
380 aa  343  3e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  47.4 
 
 
391 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  47.4 
 
 
391 aa  338  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  46.58 
 
 
391 aa  338  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  47.12 
 
 
392 aa  337  2e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  46.3 
 
 
391 aa  337  3e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  46.3 
 
 
391 aa  337  3e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  46.03 
 
 
391 aa  336  4e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  46.03 
 
 
391 aa  336  4e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  46.3 
 
 
391 aa  336  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  46.17 
 
 
398 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  46.09 
 
 
370 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  46.03 
 
 
391 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  45.23 
 
 
851 aa  325  8e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  46.85 
 
 
408 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  43.24 
 
 
380 aa  305  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.64 
 
 
403 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.64 
 
 
403 aa  289  5e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  41.37 
 
 
403 aa  289  5e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  43.24 
 
 
364 aa  286  3e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  42.93 
 
 
384 aa  283  5e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.32 
 
 
395 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  41.62 
 
 
387 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  40.05 
 
 
388 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.49 
 
 
811 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.42 
 
 
378 aa  275  1e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  39.95 
 
 
376 aa  275  1e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.88 
 
 
375 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  41.24 
 
 
389 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.63 
 
 
406 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  40.05 
 
 
395 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  39.36 
 
 
434 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  41.69 
 
 
367 aa  269  6e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  39.63 
 
 
433 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  42.12 
 
 
389 aa  268  9e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  41.33 
 
 
380 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  42.12 
 
 
389 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  41.03 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  41.58 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.95 
 
 
387 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.48 
 
 
411 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.56 
 
 
395 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  43.97 
 
 
364 aa  259  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  38.2 
 
 
379 aa  259  5e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  35.92 
 
 
395 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  38.52 
 
 
382 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  36.02 
 
 
395 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  35.92 
 
 
395 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  39.2 
 
 
384 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  38.34 
 
 
421 aa  255  1e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  38.81 
 
 
379 aa  252  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  37 
 
 
393 aa  252  9e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  37.26 
 
 
402 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  40.75 
 
 
849 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  41.42 
 
 
844 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  36.9 
 
 
441 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  38.65 
 
 
366 aa  245  1e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  38.42 
 
 
382 aa  245  1e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  36.63 
 
 
417 aa  245  1e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  38.42 
 
 
382 aa  245  1e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.74 
 
 
379 aa  244  2e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  39.29 
 
 
374 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.74 
 
 
379 aa  243  4e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  35.62 
 
 
375 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  35.92 
 
 
437 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.45338e-06 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  37.77 
 
 
376 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  38.21 
 
 
365 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  38.15 
 
 
366 aa  239  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  36.84 
 
 
401 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  36.44 
 
 
397 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  36.8 
 
 
372 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  37 
 
 
405 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  40.38 
 
 
373 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>