More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0240 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  53.61 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  50.94 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 
107 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  51.46 
 
 
107 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  52.08 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
97 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  43.56 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
119 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
105 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
103 aa  84.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
111 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.42 
 
 
98 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
98 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  48.91 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  43.48 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1304  transcriptional regulator, TrmB  51 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.78 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  47.13 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1145  regulatory protein ArsR  51 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220144  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  47.25 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  43.82 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  43.16 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  43.18 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
101 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  42.11 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  42.11 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
110 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  43.18 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  43.18 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  43.18 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0149  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  43.01 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  45 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  40.66 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  37 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  43.68 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>