More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0995 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 708 aa  1409    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.31 
 
 		 690 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.17 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.74 
 
 		 690 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.88 
 
 		 690 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.88 
 
 		 690 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.2 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  45.52 
 
 		 711 aa  552  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.88 
 
 		 690 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.25 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.25 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.25 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.25 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.17 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.6 
 
 		 690 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.83 
 
 		 691 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.25 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.83 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  42.33 
 
 		 714 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.33 
 
 		 714 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.59 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.19 
 
 		 714 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.62 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.21 
 
 		 714 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.21 
 
 		 714 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.84 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.57 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  44.95 
 
 		 721 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.07 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.33 
 
 		 714 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.17 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.23 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.43 
 
 		 725 aa  505  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.94 
 
 		 694 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  44.72 
 
 		 714 aa  502  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  40.23 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.61 
 
 		 707 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.77 
 
 		 703 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.74 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.14 
 
 		 700 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.56 
 
 		 710 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.2 
 
 		 716 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 		 738 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.08 
 
 		 741 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.7 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  37.82 
 
 		 750 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.6 
 
 		 729 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.41 
 
 		 758 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.17 
 
 		 715 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.87 
 
 		 701 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.25 
 
 		 714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.25 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.25 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.25 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.21 
 
 		 699 aa  357  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.89 
 
 		 699 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.12 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.83 
 
 		 725 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 		 726 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 		 726 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.79 
 
 		 726 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.6 
 
 		 732 aa  343  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.36 
 
 		 716 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.36 
 
 		 716 aa  343  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.36 
 
 		 716 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.36 
 
 		 716 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.36 
 
 		 716 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  34.36 
 
 		 716 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  34.36 
 
 		 716 aa  342  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  34.36 
 
 		 716 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.22 
 
 		 762 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  32.58 
 
 		 664 aa  265  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.89 
 
 		 832 aa  262  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.48 
 
 		 838 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.62 
 
 		 643 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.67 
 
 		 851 aa  250  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 		 921 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  30.5 
 
 		 843 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.04 
 
 		 930 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.29 
 
 		 659 aa  246  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  33.53 
 
 		 631 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.28 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  31.02 
 
 		 840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  33.24 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.26 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.47 
 
 		 876 aa  235  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.32 
 
 		 822 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  27.1 
 
 		 636 aa  233  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  33.68 
 
 		 635 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.82 
 
 		 929 aa  232  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  31.51 
 
 		 660 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.67 
 
 		 929 aa  231  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  29.83 
 
 		 830 aa  230  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  29.51 
 
 		 639 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  29.86 
 
 		 830 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30 
 
 		 843 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  28.7 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  31.46 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  29.2 
 
 		 658 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.15 
 
 		 653 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>