37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1589 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  36.43 
 
 
270 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  39.36 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  39.84 
 
 
246 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  35.68 
 
 
254 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  35.83 
 
 
261 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  29.66 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  32.39 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  28.81 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  33.86 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  28.69 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  27.43 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  29.37 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.91 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  27.43 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28.69 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  24.71 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  26.02 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  23.77 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  27.31 
 
 
365 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  25.4 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  27 
 
 
322 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  26.32 
 
 
256 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  25.2 
 
 
241 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  25.28 
 
 
328 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  27.51 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  24.62 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  26.29 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  26.95 
 
 
339 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  23.44 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  25.47 
 
 
298 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  34.21 
 
 
328 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  36.84 
 
 
334 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>