More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1008 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.76 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
284 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.96 
 
 
292 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.88 
 
 
284 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  26.67 
 
 
289 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  25.33 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  31.31 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  24.72 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  24.77 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  25.55 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  26.46 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  25 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  25.75 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  25.43 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.32 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.53 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.72 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  23.66 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.19 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  25.52 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
226 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  27.23 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  32.26 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  22.69 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  38.16 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.09 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  21.84 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  28.95 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  23.19 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  23.66 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  38 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.58 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.14 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  28.68 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  30.46 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  29.61 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  24.68 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
276 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  36.36 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  35.63 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  27.87 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  27.05 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.17 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  24.37 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  24.37 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  34.48 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  31.58 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  26.56 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  29.01 
 
 
240 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.26 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.26 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  30.12 
 
 
291 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.8 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  40.74 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
280 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.95 
 
 
253 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.57 
 
 
282 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  31.37 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  26.27 
 
 
261 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.63 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.78 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.88 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.88 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  32.73 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.23 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  28.36 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.26 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  40 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.84 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.03 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.96 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  36.36 
 
 
199 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  29.46 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  29.46 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  25.31 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>