More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0006 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  64.95 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  64.36 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  61.46 
 
 
120 aa  133  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  52.27 
 
 
115 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
74 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2948  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
72 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000335775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  51.28 
 
 
89 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  52.94 
 
 
70 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  45.33 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  48.57 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  58.46 
 
 
71 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  50.67 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.67 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  46.25 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  55.22 
 
 
81 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  53.73 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  48.65 
 
 
132 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  44.16 
 
 
81 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  51.52 
 
 
69 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
69 aa  84  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  48.57 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  48.57 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  52.24 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  46.27 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  47.22 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  46.58 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  46.97 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  48.48 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.3 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  48.53 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  49.25 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
80 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
83 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  45.59 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  46.67 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  46.67 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  48.57 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  46.58 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  48.53 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  43.37 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  45.21 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  47.25 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  43.84 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  44.3 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.92 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  46.27 
 
 
93 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  57.81 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  45.21 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  44.16 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  41.77 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  43.24 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0306  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  49.33 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  41.33 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  41.33 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  50.7 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.74 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  45.95 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  49.23 
 
 
69 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0275  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1264  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000384202  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  49.33 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>