33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2239 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  60.9 
 
 
282 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  54.23 
 
 
276 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  54.23 
 
 
276 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  51.54 
 
 
276 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  52.67 
 
 
271 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  53.38 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  46.36 
 
 
266 aa  245  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 
267 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 
270 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  31.79 
 
 
370 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  48.65 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  45.95 
 
 
286 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.19 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
366 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
375 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  22.4 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
271 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>