28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0434 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  46.36 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  43.35 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  42.97 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  42.91 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  43.73 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  43.73 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  42.97 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.45 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  29.58 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 287 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>