32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0577 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 276 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  88.77 
 
 		 276 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  85.51 
 
 		 276 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  84.15 
 
 		 271 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  78.73 
 
 		 270 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  51.54 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  48.85 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  43.73 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  36.62 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  47.06 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  28.31 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 		 260 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>