More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0061 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  72.73 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  62.9 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  56.94 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  56.94 
 
 		 293 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  57.3 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  54.2 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  54.2 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  55.64 
 
 		 288 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  50.92 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  46.01 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  43.26 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  45.39 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  48.05 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  39.47 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  34.38 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  40.42 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.7 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  35.45 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  34.8 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.21 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 337 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  34.07 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  35.54 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  31.41 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  32.43 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  31.37 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  31.23 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  34.6 
 
 		 494 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>