38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4353 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  34.46 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  35.14 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  34.29 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.62 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.46 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  29.21 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  30.86 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  30.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  27.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.69 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  32.65 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  28.67 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.26 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.1 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.49 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  33.56 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  30.73 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  30.18 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  29.93 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.58 
 
 		 534 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  26.78 
 
 		 358 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  27.46 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  32.14 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.3 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  28.87 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  26.75 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  26.75 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  28.57 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  24.85 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  31.37 
 
 		 175 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>