43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1578 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 1006 aa  1992    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  70.86 
 
 		 1002 aa  1316    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  51.75 
 
 		 647 aa  558  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  32.53 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  32.53 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  32.53 
 
 		 868 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  30.34 
 
 		 867 aa  221  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  42.12 
 
 		 289 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  32.27 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1776 aa  97.8  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.13 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.6 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.35 
 
 		 746 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.35 
 
 		 746 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.37 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2708  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1038 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00403632  hitchhiker  0.00987423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.29 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  25 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.36 
 
 		 271 aa  63.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  33.1 
 
 		 289 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  28.57 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  30.13 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.72 
 
 		 970 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  29.47 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  28.09 
 
 		 667 aa  56.2  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  33.58 
 
 		 841 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.85 
 
 		 201 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.18 
 
 		 970 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.61 
 
 		 746 aa  53.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.09 
 
 		 201 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  25.85 
 
 		 717 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  27.47 
 
 		 1026 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  25 
 
 		 717 aa  52.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  27.47 
 
 		 1026 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  23.76 
 
 		 717 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  29.75 
 
 		 391 aa  48.5  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.07 
 
 		 304 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  32.12 
 
 		 633 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  25.62 
 
 		 266 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  45.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  29.45 
 
 		 695 aa  45.8  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.91 
 
 		 400 aa  45.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  25.99 
 
 		 658 aa  44.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>