More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1993 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 392 aa  797    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  74.94 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  73.39 
 
 		 387 aa  591  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  68.73 
 
 		 387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  67.6 
 
 		 392 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  56.48 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  52.04 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  37.6 
 
 		 830 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.76 
 
 		 832 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  36.91 
 
 		 827 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 833 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 828 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.32 
 
 		 827 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  34.64 
 
 		 776 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 820 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 843 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 818 aa  245  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 832 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 818 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 		 834 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  35.7 
 
 		 810 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 830 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  35.77 
 
 		 828 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.25 
 
 		 841 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 832 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  36.03 
 
 		 821 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 		 828 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.8 
 
 		 828 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 		 835 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 835 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  33.42 
 
 		 835 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  33.96 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.68 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  34.29 
 
 		 835 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  35.79 
 
 		 712 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  33.42 
 
 		 361 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.68 
 
 		 836 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.6 
 
 		 816 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  33.68 
 
 		 840 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.79 
 
 		 833 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.13 
 
 		 836 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.28 
 
 		 370 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.69 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  33.51 
 
 		 820 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  33.42 
 
 		 841 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  35.86 
 
 		 836 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.68 
 
 		 842 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.28 
 
 		 784 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.28 
 
 		 784 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  32.28 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  35.01 
 
 		 347 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  32.01 
 
 		 784 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.01 
 
 		 784 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  34.97 
 
 		 836 aa  217  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 784 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 		 843 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  31.75 
 
 		 784 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.97 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.85 
 
 		 842 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 		 785 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.87 
 
 		 842 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 		 784 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 842 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.13 
 
 		 837 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.39 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 854 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  32.56 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.75 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.9 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.09 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.72 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.23 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  30.81 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  31.55 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.87 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.73 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.13 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  28.83 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.74 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.13 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.59 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.85 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.23 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  31.1 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.53 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.64 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>