More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0750 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  73.43 
 
 
430 aa  675  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  69.56 
 
 
429 aa  649  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  68.31 
 
 
428 aa  642  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
429 aa  884  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  74.7 
 
 
423 aa  680  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  60 
 
 
432 aa  539  1e-152  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  58.2 
 
 
433 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  56.18 
 
 
433 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  53.95 
 
 
432 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  54.31 
 
 
433 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  54.46 
 
 
438 aa  471  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  53.26 
 
 
441 aa  466  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  53.15 
 
 
433 aa  466  1e-130  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  52.44 
 
 
433 aa  468  1e-130  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 
433 aa  467  1e-130  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  52.56 
 
 
433 aa  464  1e-130  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  51.16 
 
 
434 aa  461  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  52.09 
 
 
432 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  51.86 
 
 
434 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  51.4 
 
 
435 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  52.33 
 
 
433 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  54.08 
 
 
433 aa  461  1e-128  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
434 aa  459  1e-128  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
434 aa  460  1e-128  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  51.75 
 
 
433 aa  461  1e-128  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
436 aa  458  1e-128  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.95 
 
 
434 aa  461  1e-128  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  51.16 
 
 
432 aa  459  1e-128  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  51.4 
 
 
435 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 
439 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  55.39 
 
 
432 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
433 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 
434 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  51.4 
 
 
434 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  50.47 
 
 
433 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 
432 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 
432 aa  454  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  52.55 
 
 
433 aa  454  1e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
433 aa  452  1e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  52.44 
 
 
435 aa  453  1e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  51.86 
 
 
435 aa  453  1e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
432 aa  452  1e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 
446 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  50.93 
 
 
439 aa  448  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
433 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
433 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  51.28 
 
 
433 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  52.08 
 
 
431 aa  446  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  50.93 
 
 
433 aa  447  1e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  446  1e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
434 aa  446  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
433 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  52.44 
 
 
434 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
434 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  50.7 
 
 
439 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
439 aa  441  1e-122  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
433 aa  440  1e-122  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  50.93 
 
 
444 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
436 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  50.7 
 
 
444 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  47.16 
 
 
430 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  47.67 
 
 
432 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
433 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
433 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  51.2 
 
 
423 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 
436 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  48.14 
 
 
436 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
433 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
435 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  48.6 
 
 
435 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  51.75 
 
 
433 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  46.37 
 
 
432 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  49.42 
 
 
437 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.25462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
444 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  47.67 
 
 
433 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  48.02 
 
 
432 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 
434 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  47.44 
 
 
430 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  51.57 
 
 
441 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  51.57 
 
 
441 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.08 
 
 
441 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  46.37 
 
 
434 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 
444 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  48.72 
 
 
443 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  49.88 
 
 
446 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  48.48 
 
 
437 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 
428 aa  405  1e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  47.1 
 
 
433 aa  407  1e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  44.6 
 
 
428 aa  405  1e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  44.63 
 
 
432 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  47.9 
 
 
440 aa  400  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  47.63 
 
 
441 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  47.9 
 
 
440 aa  399  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  49.64 
 
 
445 aa  400  1e-110  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  47.9 
 
 
440 aa  399  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  44.78 
 
 
435 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  46.93 
 
 
441 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  47.16 
 
 
441 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>