39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0477 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 156 aa  313  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  42.66 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  43.66 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  43.45 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  38.03 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  44.78 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  40.41 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  35.86 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  37.04 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  35.17 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  33.11 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  34.97 
 
 		 327 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  35.97 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  39.45 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  42.48 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  31.62 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  36.17 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  34.65 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0179  hypothetical protein  43.59 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00912885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  39.34 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  30.71 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  39.25 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  31.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  30.09 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  37 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  31.96 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  39.45 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  26.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  29.51 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  31.68 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  31.68 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3436  C_GCAxxG_C_C family protein  26.71 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1769  hypothetical protein  32.17 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.06784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  39.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>