More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1073 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  100 
 
 		 338 aa  697    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  66.77 
 
 		 336 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  69.82 
 
 		 330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  66.56 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  58.1 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  51.11 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  46.25 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  44.27 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  46.84 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  43.96 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  41.18 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  43.65 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  43.65 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  38.79 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  36.64 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  36.42 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  37.46 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  37.13 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  38.87 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  36.34 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  36.31 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  36.36 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  36.13 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  32.83 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  32.93 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  35.86 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  37.04 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  34.13 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 		 479 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  35.12 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  31.42 
 
 		 481 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 		 471 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.23 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.34 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.34 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  26.46 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  29.13 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.14 
 
 		 777 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  31.13 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.68 
 
 		 768 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  28.4 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.57 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.17 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  27.83 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  22.29 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  28.31 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.19 
 
 		 742 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  28.44 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  24.84 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.01 
 
 		 744 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  29.25 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  26.33 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  29.33 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  26.11 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.52 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  26.85 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.22 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.68 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  26.92 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30 
 
 		 715 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  25.5 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  27.14 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  26.46 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.24 
 
 		 736 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  25.97 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.6 
 
 		 724 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.35 
 
 		 802 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  26.19 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.66 
 
 		 742 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.97 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.79 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  27.27 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.54 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  22.97 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  23.36 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.46 
 
 		 736 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  29.41 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  23.55 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.7 
 
 		 775 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  27.35 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  26.87 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  27.51 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  21.71 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  25.66 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  25 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.65 
 
 		 794 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.49 
 
 		 702 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0668  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.42 
 
 		 724 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  30.71 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.2 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  24.92 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.76 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  31.88 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>