More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1980 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1693  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.3 
 
 
709 aa  924    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.708191  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
702 aa  1414    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0668  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.59 
 
 
724 aa  451  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.09 
 
 
733 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.3 
 
 
693 aa  434  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389559  normal  0.625325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0101  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.97 
 
 
693 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00123844  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.71 
 
 
742 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.67 
 
 
742 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0780  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38 
 
 
721 aa  426  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0313655 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2051  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.33 
 
 
715 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00206417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.77 
 
 
729 aa  422  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.09 
 
 
729 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.36 
 
 
739 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.09 
 
 
729 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.82 
 
 
727 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.07 
 
 
739 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.59 
 
 
739 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.43 
 
 
739 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.93 
 
 
739 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.93 
 
 
739 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.29 
 
 
739 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.93 
 
 
739 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.43 
 
 
739 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.93 
 
 
739 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.39 
 
 
752 aa  415  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2178  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.63 
 
 
697 aa  415  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0398131  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.25 
 
 
744 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.89 
 
 
730 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.79 
 
 
739 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.54 
 
 
733 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.9 
 
 
764 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.13 
 
 
732 aa  403  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.41 
 
 
739 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.11 
 
 
733 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  38.4 
 
 
727 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.55 
 
 
777 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.85 
 
 
802 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.82 
 
 
766 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.29 
 
 
779 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.95 
 
 
736 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.1 
 
 
733 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.11 
 
 
750 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.14 
 
 
739 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.22 
 
 
758 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.67 
 
 
737 aa  395  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.8 
 
 
779 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.13 
 
 
715 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.5 
 
 
765 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.35 
 
 
737 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.98 
 
 
764 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.86 
 
 
749 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.92 
 
 
724 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.59 
 
 
740 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.87 
 
 
761 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.25 
 
 
744 aa  389  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.67 
 
 
741 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.69 
 
 
737 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.22 
 
 
743 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.19 
 
 
779 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.54 
 
 
717 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.35 
 
 
754 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.73 
 
 
761 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.54 
 
 
761 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.8 
 
 
737 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.58 
 
 
777 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.59 
 
 
767 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.41 
 
 
775 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3537  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.34 
 
 
738 aa  386  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.98 
 
 
758 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.59 
 
 
767 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.26 
 
 
751 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.36 
 
 
804 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.9 
 
 
761 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.48 
 
 
779 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1885  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.82 
 
 
693 aa  381  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.48 
 
 
768 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.25 
 
 
781 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0081  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.33 
 
 
693 aa  382  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.239309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.03 
 
 
754 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.99 
 
 
735 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.37 
 
 
741 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.91 
 
 
737 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.73 
 
 
794 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0822  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.98 
 
 
752 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.01 
 
 
768 aa  379  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.48 
 
 
719 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.15 
 
 
752 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.37 
 
 
741 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.24 
 
 
734 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.03 
 
 
764 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.33 
 
 
723 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.32 
 
 
712 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.32 
 
 
787 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.83 
 
 
769 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.97 
 
 
719 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.78 
 
 
758 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  34.46 
 
 
770 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.18 
 
 
719 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.6 
 
 
727 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.1 
 
 
709 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.36787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>