More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1265 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  56.98 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  38.55 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.81 
 
 		 270 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 276 aa  84.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  29.84 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  32.24 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  31.32 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  32.81 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  30.06 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 258 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  31.77 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  35.14 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  32.39 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  29.9 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  30.32 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 269 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  30.98 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  33.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  30.05 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  26.7 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  32.16 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 278 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 279 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  28.34 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  43.56 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  40.66 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  29.03 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  30.81 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  29.28 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  43.53 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  28.34 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  25.13 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  34.72 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  31.43 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  31.74 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  33.12 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  34.91 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  27.41 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  27.89 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  27.57 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.57 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  27.89 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5868  molybdenum-pterin binding protein (Mop)  48.53 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  43.18 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  26.23 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  37.37 
 
 		 111 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  48.44 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  32.38 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  32.38 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  48.44 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4168  TOBE domain-containing protein  46.27 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000227017  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3872  molybdenum-pterin binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  29.63 
 
 		 269 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4442  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.973007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>