63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0109 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  66.67 
 
 		 253 aa  349  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  60.32 
 
 		 251 aa  305  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  61.54 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  59.76 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  58.23 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  56.73 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  54.73 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  57.61 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  54.32 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  52.26 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  53.53 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  53.04 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  50.8 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  49.6 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  48.81 
 
 		 252 aa  214  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  46.43 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  48.8 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  45.12 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  45.45 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  46.8 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  44.53 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  49.19 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  46.15 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  45.34 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  46.09 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  40.87 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  38.17 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  38.93 
 
 		 363 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  36.65 
 
 		 397 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  37.6 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  35.22 
 
 		 372 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  37.1 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  30.27 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0814  50S ribosomal protein L4  28.92 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0012008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  26.41 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  26.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  26.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  24.22 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0051  50S ribosomal protein L4  28 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000062417  hitchhiker  3.36643e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  27.91 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  26.74 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  32.95 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0054  50S ribosomal protein L4  28.95 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000793849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0279  50S ribosomal protein L4  32.74 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000793566  hitchhiker  0.00000000126953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0274  50S ribosomal protein L4  32.74 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  28.07 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  24.14 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  25.65 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  25.68 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  25 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  28.16 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  26.29 
 
 		 206 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  29.24 
 
 		 206 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>