More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1585 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.35 
 
 
714 aa  673  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.38 
 
 
714 aa  642  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.18 
 
 
714 aa  649  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.32 
 
 
714 aa  665  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.32 
 
 
714 aa  648  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.04 
 
 
714 aa  662  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.56 
 
 
714 aa  665  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.32 
 
 
714 aa  647  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.8 
 
 
721 aa  639  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  47.46 
 
 
714 aa  665  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  48.69 
 
 
714 aa  667  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.32 
 
 
714 aa  647  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  8.38668e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
725 aa  1477  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  46.13 
 
 
720 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  43.86 
 
 
707 aa  598  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  7.14427e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  42.41 
 
 
708 aa  494  1e-138  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.12 
 
 
690 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.9 
 
 
690 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.84 
 
 
690 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  3.22681e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.84 
 
 
690 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.07 
 
 
692 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  4.11022e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.07 
 
 
690 aa  482  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 
690 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 
690 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.21 
 
 
691 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 
690 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.79 
 
 
692 aa  479  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20367e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.43 
 
 
690 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.74 
 
 
691 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.57 
 
 
690 aa  475  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 
690 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.34 
 
 
691 aa  467  1e-130  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  37.98 
 
 
691 aa  468  1e-130  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.38 
 
 
712 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.74 
 
 
691 aa  461  1e-128  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.16 
 
 
694 aa  455  1e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.46 
 
 
686 aa  448  1e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.48 
 
 
703 aa  438  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.1 
 
 
711 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.78 
 
 
729 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.65 
 
 
758 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.76 
 
 
741 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.39 
 
 
692 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.29 
 
 
716 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  36.12 
 
 
750 aa  357  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.35 
 
 
738 aa  356  8e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.18 
 
 
700 aa  348  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.6 
 
 
710 aa  337  6e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.65 
 
 
715 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.65 
 
 
726 aa  333  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.65 
 
 
726 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.65 
 
 
726 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.39 
 
 
699 aa  322  2e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.81 
 
 
699 aa  320  4e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.66 
 
 
701 aa  320  8e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.93 
 
 
714 aa  315  2e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.93 
 
 
714 aa  314  3e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.93 
 
 
714 aa  315  3e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.93 
 
 
714 aa  313  5e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.79 
 
 
714 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.83 
 
 
732 aa  311  3e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.56 
 
 
716 aa  308  2e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.25 
 
 
716 aa  307  4e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  32.25 
 
 
716 aa  307  5e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  32.25 
 
 
716 aa  307  5e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  32.25 
 
 
716 aa  307  5e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.56 
 
 
762 aa  307  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.38 
 
 
716 aa  306  1e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.38 
 
 
716 aa  306  1e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.25 
 
 
716 aa  306  1e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.39 
 
 
725 aa  305  2e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  27.67 
 
 
832 aa  260  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.7 
 
 
643 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  31.62 
 
 
840 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  33.01 
 
 
851 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.94 
 
 
957 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  31.71 
 
 
843 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.45 
 
 
659 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  26.9 
 
 
822 aa  247  5e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  30.37 
 
 
646 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  32.21 
 
 
729 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.38 
 
 
664 aa  236  1e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.46 
 
 
930 aa  235  2e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  27.18 
 
 
636 aa  234  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  30.45 
 
 
674 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  30.27 
 
 
754 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.75 
 
 
661 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  9.73223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  28.99 
 
 
658 aa  225  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  31.21 
 
 
651 aa  223  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  28.97 
 
 
647 aa  223  1e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.12 
 
 
952 aa  222  1e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.94 
 
 
929 aa  222  2e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  33.14 
 
 
688 aa  220  9e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.82 
 
 
667 aa  218  3e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  32.86 
 
 
688 aa  218  3e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.52 
 
 
929 aa  217  6e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  28.36 
 
 
751 aa  214  3e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.91 
 
 
934 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  28.66 
 
 
639 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  28.59 
 
 
749 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>